顺治的大军一路沿着运河南下。本来，太后打算向李存真发出一些信号误导他说顺治将会从河南地区直接进攻凤阳。骗开李存真的主力，好使清军能趁李存真不备，一举抵达扬州，威慑南京。
可是，顺治的大军人数众多，实在也无法隐藏行踪。到了六月，顺治的大军便过了山东，汇合了山东绿营祖泽溥，便朝着徐州杀来。
南京。常琨用水刑处决了甄从满。那家伙可能是上了太后和索丰的当，非故意地误导常琨说顺治不会南征，也可能是得了太后的好处，舍得一条命，就是要骗常琨等人上当。总之，甄从满的消息是假的，顺治真的南下了，这出乎南明方面的意料。
李存真本以为有时间应付，可是顺治急急而来，竟然没有给他太多准备的时间。
两个月内李存真集结了十万人，其中最有战斗力的还是自己的老营，同时还有原明郑的兵将。通过老兵带新兵的方法，现在的人数比北上的时候多了很多，勉强也有一战之力了。
其中有淮东军的第一师，淮西军的第一师，近卫军的第一师。同时，李存真通过思想政治工作又转化了不少满清绿营的披甲兵，主要是近卫军的第二师和第三师。其中近卫军第二师是满员的编制，许多都是曾经的绿营老兵。李存真认为即便是旧式兵将，照样也有击败满清的实力。否则李定国的西营也不是新式军队，照样两撅名王。近卫军第三师，有一些是投降的绿营兵，但是还有一个半团都是新招募的南京、镇江等地的市民组成的新兵。
李存真将这十万人从徐州、邳州、宿迁、清河、淮安直至高邮一路纵向排开。摆了个一字长蛇阵，不过，这不是一条东西走向的蛇，而是南北走向的蛇。蛇头就在徐州，而蛇尾则在扬州、高邮一带。
李存真期望通过节节抵抗，伴随着江南的梅雨，消耗清军的实力，使清军抵达高邮州附近的时候已经筋疲力尽。而明军便可以趁势反击，一举击败清军。
六月末，满清安亲王岳乐和赖塔率领满清前锋与赵无极的淮东军在徐州城外打了一仗，稍一接触，淮东军便撤退入徐州城。清军随即围困徐州。
不久，清军架起火炮攻城。赵无极在城内也组织反击，双方争夺了一天，互有死伤。夜里，赵无极打开徐州南门，率领军队从南面突围。
顺治本以为这是一个围点打援的大好时机，也没有认为明军会如此轻易地放弃徐州，并没有做更多的防范。导致，突围的明军拼死杀出，却没有遇到什么像样的拦截，很快突破清军的包围。后面的淮东军第一师的两个团，很快穿过清军防线南下。
此后在邳州，也就是三国时的下邳也是如此。清军攻城，明军给予清军杀伤之后便南下。
从徐州到邳州再到宿迁，清军整整打了两个月。
到了七月末，江南的梅雨正是下得粘稠的时候。清军冒雨前进，好不容易推进到了淮安城下。此时李存真率领明军主力，乘坐战船北上也来到淮安。
淮安府最著名的当属洪泽湖。洪泽湖碧波荡漾，如同一滴眼泪静静地淌在淮南大地上。
此时的洪泽湖与后世不同。后世的洪泽湖如同一把倒立的镰刀，刀刃朝北，刀柄也指向北面，这是由于黄河多次改道，造成淮河流域泛滥所致。其中泥沙淤积，导致湖水蓄洪能力减弱，常常发生水患。
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